O curso iniciou em abril de 1990, autorizado pelo Decreto nº 95.623, de 12 de janeiro de 1988, com base no Parecer CFE 1.128/87 de 03 de dezembro de 1987, e reconhecido pelo Ministério de Educação e Desporto através da Portaria 687 de 9 de maio de 1994.
Em agosto de 1991, o prédio 20 foi inaugurado com a utilização dos laboratórios para as aulas práticas, salas para aulas teóricas, apoio docente e almoxarifado.
Em março de 1992, iniciou-se o atendimento de pacientes nas duas clínicas, cada uma com 48 conjuntos odontológicos e seis aparelhos de RX de apoio. Implantou-se, ao mesmo tempo, o serviço de triagem para seleção e encaminhamento dos pacientes para as diferentes disciplinas clínicas.
Em março de 1993, o curso passou a oferecer um Programa de Internato, aberto a cirurgiões-dentistas, com objetivo de aperfeiçoamento em disciplinas isoladas. Desde então, entre 15 a 20 disciplinas matriculam internos semestralmente.
Em 12 de agosto de 1994 ocorreu a colação de grau da primeira turma com 43 cirurgiões-dentistas. No mesmo ano houve a necessidade de ampliação das instalações, tendo em vista o aumento crescente de alunos matriculados e a implantação do Programa de Pós-Graduação, previsto para o primeiro semestre de 1995.
Em 1995, iniciou-se o Programa de Pós-Graduação com seis cursos de especialização: Cirurgia e Traumatologia Buco-Maxilo-Faciais (CTBMF), Dentística Restauradora, Endodontia, Odontopediatria, Periodontia e Prótese Dentária; e dois cursos de mestrado: Periodontia e CTBMF.
Em março de 1997, iniciaram novas turmas dos cursos de especialização e mestrado, acrescidos de mais dois cursos de mestrado: Endodontia e Prótese Dentária.
Em 1998 foi criado o curso de especialização em Ortodontia e o mestrado em Dentística, e em 2002 o mestrado de Odontopediatria. Em 2005, o curso passou a oferecer doutorado em Odontologia.
No ano de 2002, iniciaram as obras do prédio novo. A construção buscou acomodar o crescimento do curso durante seus 15 anos, tanto em número de alunos como em atendimento à demanda de pacientes. Em 12.400m2, foram projetados laboratórios técnicos e de imagem; cinco clínicas para atendimento à população; bloco cirúrgico para intervenções maiores; laboratórios de informática; auditório com capacidade para 250 pessoas; nove salas de aula; e, área de lazer. A mudança para o prédio 59 ocorreu em julho de 2005.
Em 2005 foi comemorado os 15 anos do curso. A celebração envolveu a inauguração do prédio 59 e a realização do 9º COLA - Congresso Odontológico Latino Americano.
Em 2010, o curso comemorou 20 anos de sua fundação. Entre as atividades comemorativas realizadas, tivemos o lançamento do livro Odontologia 20 anos, que conta a história do curso desde sua idealização. Ainda foi inaugurado, junto ao auditório do Prédio 59, um painel com imagens retrospectivas que mostram momentos importantes desses 20 anos.
Coordenadores/Diretores do curso
Professor Breno Futuro (1990/1991)
Professor José O. Schneider Santos (1992/1997)
Professor Ricardo Prates Macedo (1998/ 2005)
Professor Pedro Antonio Gonzàlez Hernàndez (2006 / 2009)
Professor Adair Luiz Stefanello Busato (2009/...)