Laboratório de Bioinformática Estrutural

Objetivos

  • Triagem virtual de moléculas bioativas;
  • Modelagem ADMETox;
  • Análise, simulação e predição das propriedades gerais de macromoléculas biológicas (DNA, RNA, proteínas e polissacarídeos);
  • Predição de estruturas tridimensionais de proteínas novas, a partir de dados estruturais de proteínas homólogas obtidas e determinadas experimentalmente;
  • Estudo in silico sobre o efeito de mutações na estabilidade e na especificidade de proteínas;
  • Planejamento racional de fármacos, através do emprego de técnicas como 3D-QSAR e modelagem sítio-dirigida;
  • Análise e avaliação temporal da dinâmica conformacional e da dinâmica das interações de proteínas e seus complexos;
  • Integração da análise de dados genômicos e estruturais;
  • Testar e avaliar hipóteses a partir experimentos executados in silico, ou ainda na aquisição de informações complementares cuja obtenção experimental (in vitro ou in vivo) seja impossível (ou difícil) de ser obtida.

Linhas de Pesquisa

  • Estudo das relações estrutura-função de macromoléculas biológicas;
  • Planejamento de agentes terapêuticos.

Técnicas e Serviços

  • Simulações por Dinâmica Molecular;
  • Modelagem por homologia;
  • Docagem molecular;
  • Screening virtual;
  • Métodos de avaliação de energia livre de ligação;
  • Métodos quânticos semiempírico e ab initio;
  • Métodos em Bioinformática;
  • Desenvolvimento de software para soluções em Biologia Computacional e Bioinformática;
  • Análise de sequências, incluindo aplicações em farmacogenômica e farmacogenética;
  • Planejamento racional de fármacos;
  • Prospecção de moléculas bioativas.

Contato
Prof. Dr. Hermes Luis Neubauer de Amorim
Fone: (51) 3477-4000 Ramal 2774 - E-mail: hermes.amorim@ulbra.edu.br

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