Laboratório de Bioinformática Estrutural

Objetivos

• Triagem virtual de moléculas bioativas;
• Modelagem ADMETox;
• Análise, simulação e predição das propriedades gerais de macromoléculas biológicas (DNA, RNA, proteínas e polissacarídeos);
• Predição de estruturas tridimensionais de proteínas novas, a partir de dados estruturais de proteínas homólogas obtidas e determinadas experimentalmente;
• Estudo in silico sobre o efeito de mutações na estabilidade e na especificidade de proteínas;
• Planejamento racional de fármacos, através do emprego de técnicas como 3D-QSAR e modelagem sítio-dirigida;
• Análise e avaliação temporal da dinâmica conformacional e da dinâmica das interações de proteínas e seus complexos;
• Integração da análise de dados genômicos e estruturais;
• Testar e avaliar hipóteses a partir experimentos executados in silico, ou ainda na aquisição de informações complementares cuja obtenção experimental (in vitro ou in vivo) seja impossível (ou difícil) de ser obtida.

Linhas de Pesquisa

• Estudo das relações estrutura-função de macromoléculas biológicas;
• Planejamento de agentes terapêuticos.

Técnicas e Serviços

• Simulações por Dinâmica Molecular;
• Modelagem por homologia;
• Docagem molecular;
• Screening virtual;
• Métodos de avaliação de energia livre de ligação;
• Métodos quânticos semiempírico e ab initio;
• Métodos em Bioinformática;
• Desenvolvimento de software para soluções em Biologia Computacional e Bioinformática;
• Análise de sequências, incluindo aplicações em farmacogenômica e farmacogenética;
• Planejamento racional de fármacos;
• Prospecção de moléculas bioativas.